Ce musée est en grande partie composé d'une collection léguée par deux artistes, Guy Bardone et René Genie.

Le musée de l'abbaye a ouvert ses portes à Saint-Claude en 2008. Il est situé dans l'ancien palais abbatial édifié entre le XVème et le XVIIIème siècle, entièrement restauré pour l'occasion, à côté de la cathédrale Saint-Pierre.
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